課程資訊
課程名稱
 高通量技術概論與數據分析
Introduction to high-throughput technique and data analysis 
開課學期
 110-2 
授課對象
 醫學院  基因體暨蛋白體醫學研究所  
授課教師
 張以承 
課號
 Genom7008 
課程識別碼
 455 M0080 
班次
  
學分
 2.0 
全/半年
 半年 
必/選修
 選修 
上課時間
 星期五3,4(10:20~12:10) 
上課地點
 基醫405 
備註
 本課程中文授課,使用英文教科書。與江士昇、周祐吉、鄭婷仁、劉傳崑、陳逸然、柯屹又、吳盈達、張七鳳合開。與陳冠元、許家郎、陳沛隆、潘思樺、林靖愉合授
總人數上限：60人 
Ceiba 課程網頁
 http://ceiba.ntu.edu.tw/1102Genom7008_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
 核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

生物體複雜度極高, 現代生物醫學逐漸由”hypothesis-driven”轉成”hypothesis-free”, 高通量技術將成為必備之知識, 整個基因組乃至於整個國家, 都成為分析的目標, 本課程介紹常用全基因組定序, 轉錄體, 蛋白體學, 與代謝體學方法。並介紹全基因組RNAi/CRISPR 篩選, 全基因組基因剔除小鼠資源, 高通量小分子藥物篩選, 虛擬分子對接, 與人體生物醫學資料庫乃至於與全民健保資料庫的連結。課程除了技術概論, 還包含數據分析之基本原理。

課程旁聽請寄信聯絡TA: r10455008@ntu.edu.tw 

課程目標
 熟悉實驗室常用高通量技術之原理與分析技巧 
課程要求
 簽到(50%)、報告(40%)、課堂討論 (10%) 
預期每週課後學習時數
  
Office Hours
  
指定閱讀
 待補 
參考書目
 Nature Biotechnology: Computational Biology Primers

http://www.liacs.nl/~hoogeboo/mcb/nature_primer.html 
評量方式
(僅供參考)
    
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
 2022/2/18  Introduction to basic concept 台大醫學院基蛋所-張以承
 
第2週
 2022/2/25  Genome-wide association and linkage analysis 台大醫學院基蛋所-張以承
 
第3週
 2022/3/4  停課 
第4週
 2022/3/11  Cheminformatics 中研院基因體研究中心-吳盈達 
第5週
 2022/3/18  The Application of Computer Modeling for Drug Design 藥騰有限公司-柯屹又 
第6週
 2022/3/25  Transcriptome 台大醫院醫研部- 許家郎 
第7週
 2022/4/1  Single cell Transcriptome 國家衛生研究院-江士昇 
第8週
 2022/4/8  Drug discovery and Pre-clinical development of small molecules 逸達生物科技股份有限公司-楊文津 
第9週
 2022/4/15  Genome-wide RNAi/CRISPR screening 中研院生醫轉譯研究中心-周祐吉 
第10週
 2022/4/22  Next-generation sequencing ( I ) 台大醫學院基蛋所-陳沛隆 
第11週
 2022/4/29  Next-generation sequencing ( II ) 道品股份有限公司 -劉傳崑 
第12週
 2022/5/6  Lipidomics 台大公衛學院-林靖愉 
第13週
 2022/5/13  Proteomics (I) 台大醫學院基蛋所-潘思樺 
第14週
 2022/5/20  Proteomics (II) 中研院農生中心-陳逸然 
第15週
 2022/5/27  Metabolomics 台大法醫所-陳冠元 
第16週
 2022/6/3  端午節（假日） 
第17週
 2022/6/10  1. Taiwan Biobank 中研院臺灣人體生物資料庫-褚候維
2. Taiwan Precision Medicine Initiative (TPMI) 中研院生物醫學科學研究所-陳建勳
 
第18週
 2022/6/17  NMR in Biomedical Research 中研院基因體研究中心-張七鳳